Für die Jungschar EMK ist eine qualitativ hochstehende Ausbildung der Leiterinnen und Leiter sowie ihre permanente Weiterbildung von zentraler Bedeutung. Dazu bietet die Jungschar EMK in Zusammenarbeit mit dem CEVI Schweiz diverse Kurse unter Jugend+Sport, Sportart Lagersport / Trekking an. Als Vorbereitung und Grundlage dazu bietet die Jungschar EMK verbandseigene Kurse an.
Die Schulungskurse der Jungschar sind modular aufgebaut und beginnen mit der Vermittlung von Jungschartechniken für Jugendliche ab 12 Jahren (Tipp-Kurse). Mit 15 Jahren kann die Grundschulung besucht werden und danach folgt mit der Gruppenleiter-Ausbildung der erste Kurs unter Jugend+Sport.